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StabilityArc提升跨蛋白稳定性预测

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AI 综述

Aaron L. Feller、Andrew D. Ellington和Claus O. Wilke提出并评测StabilityArc;在覆盖134,794个ProteinGym变体的66次严格留一蛋白评估中,模型的Spearman相关系数为0.7134,高于ProSST-2048的0.6526,显示其跨蛋白预测突变稳定性效应的表现更强。 StabilityArc通过共享RoPE Transformer解码冻结的ESMC-600M残基表示,生成各氨基酸替换的稳定性效应矩阵,并加入接触感知残差以预测同时突变的上位性。研究者还将其分数作为Kermut先验;在三种监督切分方案中,相关系数达到0.8280,高于Kermut报告的0.8167。

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报道时间线

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10月16日
  1. arXiv · Machine Learning
    StabilityArc:将蛋白质序列嵌入解码为可泛化的稳定性景观

    StabilityArc通过共享RoPE transformer解码冻结的ESMC-600M残基表示,跨蛋白预测突变稳定性效应。在66次严格留一蛋白评估、覆盖134,794个ProteinGym变体中,其Spearman相关系数达0.7134,高于ProSST-2048的0.6526。将该分数作为Kermut先验后,三种监督切分方案的相关系数达0.8280,高于Kermut报告的0.8167。

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