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mdRNAcat发布48种RNA模拟数据集

1 篇报道1 个报道来源9 小时前更新

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AI 综述

论文作者介绍了 mdRNAcat,一个覆盖48种RNA系统的全原子分子动力学数据集,数据集及配套资源已在 HelmholtzAI-FZJ 组织的 Hugging Face 页面提供。 每个RNA系统包含32个哈密顿量状态,各状态生产模拟时长为200至300纳秒,并以标准化HDF5格式提供坐标和力。作者称,该数据集可用于开发和评估数据驱动的RNA模型,包括粗粒化力场。

AI 根据报道生成 · 1 小时前更新

报道时间线

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10月28日
  1. arXiv · Machine Learning
    mdRNAcat:REST2 RNA 构象系综分子动力学数据集目录

    mdRNAcat 提供覆盖 48 种 RNA 系统的全原子分子动力学模拟数据集,采用 REST2 采样构象系综。每个系统包含 32 个哈密顿量状态,每个状态的生产模拟时长为 200-300 ns;坐标和力以标准化 HDF5 格式提供。该数据集可用于开发和评估数据驱动 RNA 模型,包括粗粒化力场。

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