arXiv · Machine Learning· Anton E. Dorn, Emile de Bruyn, Fabrice von der Lehr, Philipp Knechtges, Stefan Kesselheim, Alexander Schug·· 10 小时前AI 评分43
mdRNAcat：REST2 RNA 构象系综分子动力学数据集目录
mdRNAcat: A Molecular Dynamics RNA Catalog of REST2 Conformational Ensembles
AI 导读
mdRNAcat 提供覆盖 48 种 RNA 系统的全原子分子动力学模拟数据集，采用 REST2 采样构象系综。每个系统包含 32 个哈密顿量状态，每个状态的生产模拟时长为 200-300 ns；坐标和力以标准化 HDF5 格式提供。该数据集可用于开发和评估数据驱动 RNA 模型，包括粗粒化力场。
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