TaxoMFM 融合分类层级信息构建肠道微生物组基础模型

Haochen Xue 等研究人员提出 TaxoMFM，一种将微生物分类层级结构融入自监督学习的人类肠道微生物组基础模型，旨在联合学习不同分类层级的丰度模式及群组内相对比例。研究团队同时构建了 TaxoGut-HPP 数据集，收录来自231个队列的100,806份肠道微生物组数据，涵盖40项分类任务和8项回归任务。 在跨队列零样本迁移评估中，目标队列未参与预训练或下游适配。TaxoMFM 对结直肠癌、2型糖尿病和炎症性肠病的预测 AUROC 分别达到0.838、0.736和0.722，展示了该模型在不同队列间迁移微生物组预测能力的表现。

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还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。