arXiv · Machine Learning· Haochen Xue, Anastasia Godneva, Yulong Li, Qi Cao, Zhaodong Wu, Kaiyu Liang, Jionglong Su, Eran Segal, Imran Razzak·· 8 小时前AI 评分47
TaxoMFM：融合分类层级信息的人类肠道微生物组基础模型
TaxoMFM: A Taxonomy-Aware Foundation Model for the Human Gut Microbiome
AI 导读
TaxoMFM 将微生物分类层级结构融入自监督学习，通过分类感知编码和分层组成重建，联合学习不同分类层级的丰度模式及群组内相对比例。研究构建了 TaxoGut-HPP，包含来自231个队列的100,806份肠道微生物组数据，覆盖40项分类任务和8项回归任务。跨队列零样本迁移中，其结直肠癌、2型糖尿病和炎症性肠病预测 AUROC 分别达到0.838、0.736和0.722。
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